La quinta temporada, estrenada en 2009, tiene 22 episodios y marca un punto de inflexión en la serie. La relación entre Brennan y Booth se vuelve más seria, y se presentan nuevos desafíos para los personajes. El caso del "Asesino de la Casa Blanca" es uno de los más destacados de la temporada.
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Es una de las más emotivas, culminando con el famoso episodio 100 donde finalmente vemos su primer beso real en un flashback y la cruda realidad de sus sentimientos en el presente. Al final de esta etapa, ambos deciden tomar rumbos separados (él a Afganistán, ella a las Molucas) para intentar sanar. Bones: Complete Series: Seasons 1 - 12 - TV en Google Play La quinta temporada, estrenada en 2009, tiene 22